GO

GO分析的一些小问题都记录在这里,有缘人看到了欢迎交流。

Revigo

GO network实现网站http://revigo.irb.hr/,在线的,有示例,基本一路点点点就好了,可视化可用cytoscape。

RrevigO可以通过使用依赖于语义相似性度量(representative subset of the terms using a simple clustering algorithm)来获取具有代表性的GO terms。从而将GO enrichment结果去冗余。

多试一试C值,一般推荐0.9或0.7,物种也可以多试一些。

参考

『文献阅读』REViGO - 简书 (jianshu.com)